可以调节植物体内源激S的平衡海藻同高等陆生植物一样，体内存在多种类型植物激S，如生长素、赤霉素、细胞分裂素和脱落酸等，并且同一种海藻中并不只存在一种植物激S。Ｇｕｐｔａ等采用萃取和高效液相色谱检测到石莼中同时含有赤霉素、脱落酸以及吲哚乙酸等多种植物激S，证明了海藻类植物拥有强大的生理调节功能；Ｓｔｉｒ等人利用技术分析了３大门类的３１种海藻，发现绝大多数海藻中细胞分裂素成分为玉米素和异戊烯基配合物，此外还有少量苄氨基嘌呤及其衍生物成分；吲哚乙酸及其类似物也是海藻中较为常见的植物激S，Ｃｒｏｕｃｈ等发现海藻提取物中含有吲哚乙酸成分，在泡叶藻、墨角藻以及其他海藻的碱提取液中也发现了具有生物学活性的吲哚乙酸类似物。
海藻肥的施用方法有两种，由三个不同时期施入：拌肥根施：海藻肥是天然的土壤调节剂，其中的海藻多糖不仅能吸Ｉ附重金属离子还能促进土壤形成团里结构，改善土壤孔隙等，与化肥混施后能活化土壤提高化肥利用率，达到高效增产的目的。拌肥施入的时期分别是，基础施肥期、分蘖期、孕穗期、三个时期分施。2叶面喷施：叶面喷施是当前使用多的施肥方式，这种施肥方法能快速为植物补充所需养分，加速植物的吸收满足其生长发育的需要，提高海藻肥的利用率降低成本。叶面喷施施入的时期与拌肥施入略有不同，分别是，返青期、分蘖期、孕穗期、海藻精分成三等份，分别拌入返青肥、分蘖肥和穗肥。
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